新制度「兩稅合一」，
根據每個股東的個人所得稅率繳股利所得稅。
如果一間公司賺了錢，會有「稅前淨利」，繳了營所稅後(目前 17%)，就會剩下「稅後淨利」。公司會把「稅後淨利」的一部份，發給股東，也就是「股利」，但是股東拿到這些收入，如果也要再繳一次個人所得稅，就等於是繳2次，這樣不公平，所以，財政部實施了一個制度：「兩稅合一」，就是根據每個股東自己的個人所得稅率，政府只拿每個股東該繳的稅。
整個流程是這樣：
如果自己該繳的稅，比公司先繳的營業所得稅低，就會退你錢。
但如果你該繳的稅，比公司先繳的營業所得稅高，你就要補繳稅。
(假設該公司股數 83 股，每股發放現金股利 1 元)
你的扣繳憑單金額
1. 先決定「股利淨額」
我們拿到的扣繳憑單，就會如上表：以這個例子來說，你有83股，每股現金發1元，那你會有83元的股利淨額。
2. 計算「可扣抵稅額」= 營所稅 / 稅後淨利
如上圖，我們常看到的「可扣抵稅額比率」，就是 營所稅 / 稅後淨利，
所以在這個例子 就是17 / 83 = 20.48%。
接著，可扣抵稅額 = 股利淨額 X 可扣抵稅額比率，
也就是83 X 20.48% = 17元。
3. 計算「股利總額」= 股利淨額 + 可扣抵稅額
然後，我們要算出 股利總額 = 股利淨額 + 可扣抵稅額，
也就是 83 + 17 = 100元。
為什麼要算「股利總額」呢？因為二代健保的 2% 和 你要繳的稅， 都是用「股利總額」去算的，以這個例子，二代健保費就是100 X 2% = 2元。所以，你就實領 83 – 2 = 81元。
重頭戲來了！
算出你該繳的稅、可扣抵稅額後，多退少補，如下表：
如果你的綜和所得稅稅率為 5%，那你應繳的稅 = 股利總額 X 綜所稅率，也就是100 X 5% = 5，因為 可扣抵稅額 = 17，所以還可以退稅 12。
如果你的綜所稅率為30%，那你應繳的稅是 100 X 30% = 30，但因為 可扣抵稅額 只有 17，所以你還要再補稅 13。
然而，按照目前財政部的新聞稿說明：
可扣抵稅額減半後，你的扣繳憑單 會變成：
可扣抵稅額只剩下以前的一半，所以 股利總額 會只剩83 + 8.5 = 91.5，二代健保費 = 股利總額 X 2%，所以 二代健保費 會比以前少一點點(因為股利總額變少了)，實領股利 會多一點點。
但是要繳的稅 卻多出很多，比較如下：
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